顺治初年，在经历了明末的暴政、农民起义的破坏、清军铁骑的洗劫之后，在中国这块大地上，已经变得人烟稀少，田园荒芜，断瓦残垣，破败不堪了。为了帮助年幼的儿子治理这个百废待兴的国家，孝庄竭尽全力辅佐顺治削平群雄、打击朋党，沿用汉制，厉行节俭，使国家得以休养生息，人民能够安居乐业。可惜，顺治并不争气，在爱妻董鄂妃病逝之后，一蹶不振，自己也染上天花而死亡。他的儿子康熙八岁就当上了皇帝，孝庄成了太皇太后。两年后康熙生母去世，抚养教育十岁皇帝康熙的重任又落到了孝庄肩上。她还在幕后为康熙出主意，治理朝政。

当时，四位辅佐大臣鳌拜、苏克萨哈、遏必隆、索尼矛盾重重，各有野心。孝庄对他们分化、利用，最终擒了称雄一时的鳌拜，巩固了皇权。之后没多久，三藩作乱，撤三藩，平吴三桂、耿精忠、尚之信，孝庄不但支持康熙力排众议，而且多次拿自己的份银犒赏出征的将士，深得人心。

在蒙古察哈尔部布尔尼起兵反清的紧急时刻，孝庄果断推荐已被免职的大学士图海为将，从而平定了北方，稳定了大局。

康熙亲政后数年，凡重大事件，都请示孝庄而后施行。

康熙对孝庄极为孝道，曾说：“趋承祖母膝下三十余年，鞠养教诲，以致有成。”评价之高，无人能及。