立陶宛全国性的残疾人体育组织有：全国残疾人奥林匹克委员会、全国聋人体育协会、全国肢残人体育协会。各运动项目的全国单项协会不专门开展残疾人体育运动，但某些单项协会允许残疾人参加锦标赛（如游泳、田径协会）。