中国科学家绘出 SARS病毒精细“家谱”

  中国科学院理论物理所郝柏林院士及其领导的科研小组最近采用全新的方法,在SARS病毒不同毒株之间的亲缘关系以及与其它冠状病毒的进化关系研究方面取得进展。

  科学时报今日报道,研究人员首先选取6个完整的SARS基因组和14个已知的冠状病毒的完全基因组(与SARS同属Nidovirales科),利用“组分矢量”方法探讨这些基因之间的进化关系。从已经得到的进化树可以看出,在全基因组的层次上,选定的6个SARS毒株相互之间关系较近,在进化树上形成单群,而与已知的冠状病毒距离比较远,说明SARS冠状病毒是冠状病毒属的独立种群。

  据称,由于SARS冠状病毒各个毒株之间的差异太小,如此构建的进化树并不足以区别出SARS病毒之间的亲缘关系,研究人员在传统的“距离矩阵方法”基础之上,使用“超度规”算法得到了具有精细结构的带根亲缘树,这与以前的研究所得到的无根亲缘树相比成为一个更有意义的结果。(王晓枫)

中新网2003年8月15日


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