葛洲坝大江截流形成阻隔后，自1984年起，中华鲟研究所每年都要人工投放中华鲟幼苗，以弥补自然繁殖的不足。经过多年的努力，通过反复试验，解决了捕捞、运输、暂养、催产、受精、孵化、培育、放流等一系列生产工艺上的技术难题，已向长江水域放流了数百万条幼体。这样，长江口中华鲟幼鱼种群应该同时包含来自自然和人工繁殖的个体。

通过对人工放流幼鲟进行荧光标记，可以把它们与自然繁殖的个体区分开来，以期对中华鲟的资源现状和人工繁殖放流效果作出准确的评价。荧光标记技术在国际上多应用于硬骨鱼类，我国自1995年开始将这项技术应用于属于软骨硬鳞鱼类的中华鲟，评价其人工繁殖放流的效果。经过多年的研究，已经形成了一套完善的大规模标记和对幼鲟无损害的检测标记的技术，并进行了成功的实践，我国在珍稀鱼类的大规模标记放流技术上已经取得了实质性的突破。

中华鲟的人工繁殖和放流过程是首先在长江网捕中华鲟，运往中华鲟研究所暂养池中蓄养。然后进行性腺观察，将确认成熟的个体进行人工注射催化剂，促使雌性产卵、雄性排精，再经过复杂的人工授精等程序后，将受精卵送进孵化池进行孵化。10龄的幼体即可投饵喂养，由于所需饵料极多，还专门建有生产水蚤、水蚯蚓等水生生物的饵料池。幼体长到一定程度后就可以分批放流到长江之中了。

投放的幼体的体长大约为9—11厘米，放流前首先要分批浸泡在莹光药物示剂中，为它们做上标志。应用大规模荧光浸泡标记时，鱼体上最佳标记靶器官是耳石，这是因为耳石处在内耳之中，不易受外界环境的干扰，标记能长久保存，此外，耳石的生长方式是以其原核为中心，一层一层沉积的，有利于以后检测时确定标记部位。因此目前国际上鱼类大规模浸泡标记的研究对象都是具有耳石的真骨鱼类。而中华鲟属于软骨硬鳞类，内耳中没有耳石存在，只有一些分散的耳沙，显然不能作为标记靶器官，只能选择骨板、锁骨、鳍条等骨质部位检测荧光标记的存在与否。

荧光浸泡试剂的选择：通过一系列的对照实验，茜素络合酮最终被选择用于中华鲟的荧光标记浸泡试剂。采用特定浓度的茜素络合物对中华鲟放流个体进行适当时间的浸泡，荧光物质可以在钙化层沉积，形成在荧光显微镜下可见的橘红色荧光。由于中华鲟的钙化组织有较强的黄绿色天然自发荧光，人工标记的橘红色荧光反应与其背骨板的绿色自发荧光形成鲜明的对照，标记比较容易辨认，犹如每条人工放流的中华鲟个体都带有一个特定的身份证。

荧光标记放流基本程序：在中华鲟的放流过程中，采用特定浓度的茜素络合物对中华鲟放流个体进行适当时间的浸泡后，再进行放流。然后利用利用荧光显微镜，对次年于长江口捕获的中华鲟幼鲟个体的胸鳍或背骨板部位进行检测，并根据特有的荧光标记的存在与否来区分人工放流个体和自然繁殖个体。

采用这种先进的标志放流方法，更加完善了中华鲟人工繁殖的工艺流程，不仅可以监测中华鲟的资源，而且还可以检验中华鲟人工繁殖放流后的效果。人工繁殖中华鲟的成功，使原来设想的救鱼措施取得了初步成效，也为中华鲟资源的保护和合理开发利用开辟了一条新的途径，这是中华鲟人工繁殖的一大突破，使人们担心的三峡工程对中华鲟生存环境影响的问题也因此而迎刃而解。