日本《读卖新闻》指出，马英九领导的国民党“政权”与陈水扁“政权”大不相同，台新当局对大陆改善关系，对日本则保持距离，亲日派世代渐渐退出台湾财政界，面对当下的现实，日本实有必要加强与台湾的对话。

台湾《中国时报》引述的报道称，读卖在分析时事的“解说版”中，刊登以“马英九政权的对日政策”为题，日本报纸所谓的“解说”比较偏向于个人观点，不像社论是代表报社的立场。

由读卖新闻台北支局长石井利尚署名的这篇报道指出，在钓鱼岛主权问题上，李登辉、陈水扁时并未向日本强烈主张钓鱼岛主权，此事件也凸显出马英九与前“政权”的不同，易于偏向对日本严苛的姿态。

文中分析称，国民党和民进党的历史观不同，而马英九当局的核心几乎没有“知日派”，也影响到马英九的对日政策。马英九本人和“行政院长”刘兆玄、“国安会秘书长”苏起三人都是留美博士、国民党的“外省籍精英”，因此马当局不像李登辉和陈水扁般重视日本，对日本也较不关心。

除此之外，马当局急速改善对大陆的关系，也影响到对日本的态度。陈水扁将日本定位为“共享安全保障及民主主义的同盟关系”，但是马英九主要是将日本视为“经济伙伴”。

文末主张，日本应尽速培养台湾的“知日派”。