1991年，国务院、中央军委授予钱学森“国家杰出贡献科学家”荣誉称号。这是共和国历史上授予中国科学家的最高荣誉，而钱学森是这一荣誉迄今为止唯一一位获得者。很少有人知道，钱学森在后来说过这样一句话：“‘两弹一星’工程所依据的都是成熟理论，我只是把别人和我经过实践证明可行的成熟技术拿过来用，这个没有什么了不起，只要国家需要我就应该这样做，系统工程与总体部思想才是我一生追求的”。钱老一生谦恭，从不自诩，但对于系统工程、对总体设计部思想，他十分自豪的称之为“中国人的发明”、“前无古人的方法”、“是我们的命根子”。
钱老所说的系统工程思想，恰恰是他在美国20年奠基、在中国航天近28年实践、晚年近30年学术研究所形成的智库撒手锏，是“钱学森智库”的核心思想。钱学森建立了系统科学的完备体系，开创了系统工程的中国学派，并以“社会系统”为应用研究的主要对象。“钱学森智库”的核心，是在总体设计部理念指导下，以处理开放的复杂巨系统为目标，构建的“从定性到定量的综合集成研讨厅”体系。今天，系统工程思想得到了党和国家前所未有的高度重视。中央多次强调：“改革开放是一个系统工程”、“更加注重改革的系统性、整体性、协同性”、“实施创新驱动发展战略是一个系统工程”、“环境治理是一个系统工程”。正如外国人所评价的：“作为伟大的科学家，钱学森属于20世纪；作为伟大的思想家，钱学森属于21世纪。”
中国航天第十二研究院是“钱学森智库”的第一践行者。1986年，钱学森在十二院的前身之一——原航天710所开办了“系统学讨论班”，铸就了“从定性到定量的综合集成研讨厅”体系框架，打造了“专家体系、知识体系、机器体系”相互融合的钱学森智库基础设施。十二院在“三大体系”的基础上，完善形成了“六大体系、两个平台”，即“思想库体系、数据情报体系、网络和信息化体系、模型体系、专家库体系、决策支持体系”，以及机器平台、指挥控制平台。这套体系在国民经济和社会发展的重大问题决策中，发挥了重要作用，提供了有力支持。无论是“载人航天飞船方案”的提出，还是“航天强国发展路径”的研究论证；无论是《中国的航天白皮书》，还是多个航天发展五年规划，十二院及其前身都发挥了重要支撑作用。2016年4月24日，即全国首个航天日，经中央批准、中央编办发文，在原航天707所、710所等五家正局级单位的基础上，中国航天科技集团公司第十二研究院正式重组成立，肩负着“建设钱学森智库；支撑航天、服务国家；成为军民融合产业发展的抓总单位”三大使命。首要的使命，就是建设钱学森智库。由钱学森开创、十二院发展形成的钱学森智库基础设施，是十二院建设“智库的智库”的根本所在，也是十二院推动国家治理体系和治理能力现代化的底气所在。
习近平总书记指出：“时代是思想之母，实践是理论之源”。运用支撑航天的钱学森智库，助推中国水治理迈向新高度，我们具有广阔的时代舞台，强大的实践优势。
战略上，以“文艺复兴”指引“产业兴水”。500多年前肇始于欧洲的文艺复兴，把“人”从“神”的束缚中解放出来，引发了一系列思想、科技、产业革命，迎来了现代文明的曙光。然而这些变革以“还原论”为主要方法，就是将复杂对象分解为简单对象，将全局问题分解为局部问题去解决，引发了社科的矛盾弊端。不仅在科学研究上遇到了难以突破的瓶颈，而且在社会治理上导致了不平等、不平衡、不可持续的严峻后果。钱学森认为：人类文明处于量变到质变的临界点，迫切需要一次新的文明转型，就是综合系统的“还原论”、东方的“整体论”，形成系统论的思想，以定性到定量的综合集成为基本方法，开创“第二次文艺复兴”。他同时指出，中国将发挥“第二次文艺复兴”的主战场作用，通过“系统论”的应用，使人类把握客观规律、改造客观世界的能力实现跨越式的提升，把第五次、第六次、第七次产业革命不断向纵深推进，进而消灭“三大差别”，达到“整个社会形态的飞跃”，让世界文明的“中心”从西方重回东方。钱学森认为，第六次产业革命是第二次文艺复兴的先导性实践，其途径是打造农、林、海、草、沙五大产业相互支撑的知识密集型产业，通过物尽其用、变废为宝，引发生产方式、生活方式、产业模式的巨大变革，实现几千年来中国人梦想的“沙漠变绿、黄河水清”。这为在产业层面，推动“山水林田湖”系统治理，实现经济效益、社会效益、生态效益相统一，勾画了可实现的宏伟蓝图。
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